三只羊乔妹的视频消失的原因目前尚不明确，但可能与以下几个因素有关：

视频内容争议：乔妹的视频内容中出现了一些争议性的元素，比如9秒视频中疑似的不雅声音和小号反光事件，引发了网友的广泛讨论和质疑。

视频被删除：有网友发现乔妹的视频已经从置顶位置取消并隐藏，视频数量也从155减少到154。

乔妹的回应：乔妹本人在视频评论区回应了视频消失的原因，称是小师娘当时在身后的办公室里打黑悟空游戏。然而，这一解释并未完全消除网友的疑虑。

老板的录音门事件：同一时间，三只羊老板卢某的录音门事件也引发了关注，进一步加剧了三只羊的舆论压力。

网友的猜测：由于视频的消失和背后的争议，网友们产生了多种猜测，包括是否被压力强制下架等。

综上所述，三只羊乔妹视频的消失可能是由于视频内容的争议、删除操作、乔妹的回应以及外部事件的影响等多种因素共同作用的结果。