郑成功占据厦门后，曾极力发展海上贸易，使得厦门一时热闹非凡。但十几年后，厦门却重归于寂。这期间发生了什么呢?

1661年4月21日，郑成功成功驱逐了占领台湾的荷兰侵略者，收复了台湾。这本是大好事，但在当时的清政府眼中，这是个麻烦。因为郑成功占据台湾，为他抗清增加了筹码，清政府消灭郑氏势力的难度加大了。

1662年，郑成功逝世，郑氏集团内部分裂，清政府趁机和荷兰殖民者勾结，进攻郑氏在大陆的根据地—厦门。郑成功之子郑经派人到海上截击，谁料岛上的守将投降了清军。郑经只好放弃厦门，退守台湾，厦门岛归清兵所有。

由于清兵水上作战能力比不过郑氏军队，于是清政府就想出了“迁界”这一办法，也就是划定一个濒海范围，将居住在这个范围内的居民强制迁移，以此来防止郑氏从厦门岛等沿海地区获得接济。

迁移限期三天，三天之后没迁走的，就会被杀头。三天后，清军开始扫城了，先是杀光未迁走的百姓，然后纵火烧房、烧船、烧树木，以防止被郑氏军队利用。厦门因为以前是郑成功抗清的根据地，所以清理得尤其彻底，破坏得也就尤其严重。经过这么一番折腾，那个鸟鸣林幽、富裕繁盛的厦门不见了，成了清军水师的一个停泊场所。

迁界政策确实让郑氏家族束手无策。因为那时台湾还没被开发出来，郑氏政权急需大量物资，没有大陆补给是很致命的。在这一政策作用下，施琅攻陷台湾，清政府统一全国。但不得不说，这个政策让厦门的繁华热闹戛然而止，重归于寂，对厦门伤害巨大。

迁界政策划定的濒海范围从三十里左右，到四十里、五十里，乃至二三百里不等，划定后在沿街界设界碑甚至修界墙，私自越界者杀无赦。