雅典是如何依靠数量如此之少的公民来统治雅典帝国海外广袤领土及军事殖民地便成了一个值得探讨的问题。

虽然关于雅典对其海外军事殖民地的控制与统治手段并没有详细的记载，但从雅典军事殖民地的一些相关制度与雅典对其属国的控制手段中便可管中窥豹。

雅典对军事殖民地通常采用政治、身份认同等手段进行控制。政治上，雅典加强对军事殖民地事务的监督和管理。

亚里士多德指出，伯里克利时期雅典帝国派出海外官员高达700余名。虽然有学者认为这个数字过于夸大。但结合伯里克利时期鼓励雅典公民参政的情况看，显然存在一定的合理性。

在相关铭文及其它文献中也提到过雅典的海外官员，这些官员有很多被派往雅典的海外军事殖民地，承担征收赋税、监管督军的工作，也要担任起战时组织军队的职责。

同时，雅典也会在各个军事殖民地派遣耳目密探，以防止军事殖民地的叛变动乱。在身份认同上，居住于军事殖民地的移民都是获得城邦承认的雅典公民，他们对身份与国家强烈的认同使他们将军事殖民地理解为雅典领土的一部分，为此对军事殖民地也有着强烈的控制和占有情感。

斯巴达及其伯罗奔尼撒同盟的各邦在和平十五年中飞速发展，它们的重装步兵实力已经远远超过雅典及其同盟各邦，至公元前431年已经成为雅典可畏的劲敌。

而雅典面对逐渐崛起的威胁很难坐视不理，不顾希腊其他城邦的感受，继续推行其海上霸权政策以维持其海上帝国，最终引发了这场让雅典军事殖民地从兴盛走向衰落的伯罗奔尼撒战争。

对斯巴达而言，这场战争的最终目的便是击败雅典和瓦解雅典帝国。斯巴达作为一个陆上强国，贫弱的海军使它在海上无力发动对雅典的进攻。

故斯巴达只能要求盟邦尽快建造船只与筹集海军军费，但建立一个能与雅典海军抗衡的海军并非一朝一夕之事，因此斯巴达及其同盟一方的海军便主事防守，很少进攻，斯巴达的策略便是主攻雅典的阿提卡本土。

而雅典作为海上霸国，遍布各地的军事殖民地不但可以为雅典海军提供中转与补给，更可以从这些军事殖民地中调集兵员。

但远弱于斯巴达的雅典陆军使雅典不得不将主攻方向限定于斯巴达等陆上强国的沿海地区，于是便出现了海上霸国的海外领土与陆上强国的大陆领土很少发生战争的情况。

斯巴达海上力量的孱弱使其很难守住它与盟邦在海外建立的殖民地，雅典也正是借此机会在得以在伯罗奔尼撒战争期间继续建立军事殖民地。

公元前431年，斯巴达国王阿尔奇达姆斯率领伯罗奔尼撒同盟大军入侵了阿提卡，在伯罗奔尼撒同盟大军深入阿提卡腹地的同时，雅典也在海上采取了一系列行动。

雅典派出100艘战船游走于伯罗奔尼撤半岛，试图攻占斯巴达的盟邦来逼退入侵阿提卡的军队。

虽然雅典在攻占美塞尼亚沿海的城邦麦托涅时因斯巴达军队的阻扰未果，但雅典海军在向北航行时取得了更大的战果，攻占了岛屿凯法伦尼亚及阿卡那尼亚沿岸的部分地区，由于两地距离斯巴达本土较近，雅典并未在此地建立军事殖民地，而是将位于特隆尼昂的伊庇鲁斯城镇及奥普斯对面的亚特兰大设为监视提防斯巴达的军事哨所。

同时，伯里克利为了确保帝国在萨罗尼克湾的利益与地位，防止雅典过去的敌人埃吉那起兵生事，在将此地的埃吉那人驱逐殆尽后以抽签的方式重新分配了此地的土地，建立了军事殖民地。

由于伯里克利在战争时采取了退守雅典、发挥海军优势的战略，大量的人口聚集于雅典城内，在遭受了战乱后于公元前430年在雅典城内爆发了瘟疫，城内的居民大量死亡。

此时的雅典城外被敌军围困，城内疫病泛滥、尸横遍野。再向斯巴达求和未果后，雅典的民怨达到了顶峰，对伯里克利战略的指责与质疑络绎不绝，反对伯里克利的政敌纷纷指控与攻击伯里克利，将战争所带来的瘟疫与死亡归咎于他，伯里克利被罚款并罢免了其将军的职位。

在公元前429年，伯里克利再次被雅典民众选举为将军，但之后不久伯里克利便因身染瘟疫身亡。伯里克利的时代结束了。

公元前428年，米提列涅与列斯堡的反叛给雅典带来了十分沉重的打击。在平息叛乱后，雅典首先没收了列斯堡人的舰船，拆除了米提列涅的城墙，然后将除麦提姆那外的列斯堡上的土地分为了3000份，其中300作为祭祀献给神灵，剩余的份地分配给雅典派往此地的军事殖民者。

与埃吉那不同的是，原住民并未被全部驱逐，土地仍由他们耕种，但需要每年为每块份地缴纳2米那的租金。

公元前421年，雅典将军尼基阿斯主持签订了合约，战争进入一个短暂平息的阶段。但伯里克利的去世与尼基阿斯合约的签订并没有使雅典建立开拓军事殖民地的政策陷入停滞，对米洛斯的征服与统治便是这一时期雅典海外军事殖民最直接的表现。

米洛斯早先是斯巴达的一个殖民城邦，他们在雅典与斯巴达的战争中一直保持中立，不偏向任何一方。甚至在公元前426年，雅典在率领大军蹂虐了米洛斯的领土并要求上交巨额贡金后仍保持中立。

至公元前416年，雅典军队未经通知便驻扎于米洛斯境内，并派出了雅典使者与米洛斯人谈判。

在这场实力悬殊的“米洛斯谈话”中，雅典人要求米洛斯加入雅典帝国的强硬态度与以强凌弱的霸权表现表露无遗。

米洛斯坚决不肯屈服，在雅典的围攻下英勇战斗，最终于公元前416-公元前415年的冬季投降。在雅典公民大会讨论对米洛斯的处置问题后，最终做出了处死所有被俘的米洛斯成年男性，贬卖妇女儿童为奴隶的残酷决定，而他们的土地则被分配给前去进行军事殖民的500名雅典公民。

从雅典人处理米洛斯人的方式来看，海外军事殖民地的建立必然会对该地区的原住民产生影响。

从雅典迁移而来的移民在侵占原住民原本生存空间的同时与当地原住民的处理方式也是研究雅典军事殖民地建立的重要问题。由于相关史料的缺失和不足，对于这一问题目前并没有明确的答案。

在数量众多的雅典军事殖民地中对原住民的处理一般分为三种情况：第一种是驱逐原住民离开殖民地，埃吉那等军事殖民地便是采用此种方式。

第二种是军事殖民者与原住民共处一地，如莱斯沃斯等部分离雅典本土较远的海外军事殖民地中，由于人口迁移的不便与雅典公民对驻扎此地的抵触，部分原住民被允许留居于此地，租种殖民者的份地并向其缴纳租金。

第三种是最为极端的情况，在极个别地方，雅典将该地区设为军事殖民地的过程中可能会将原住民赶尽杀绝。

虽然雅典的这种行为有失人道，但在雅典对外征服扩张的道路上常常用这种手段去威慑其他城邦，例如雅典曾经下达对希腊岛屿米提列涅屠城的命令，包括上文中雅典对米洛斯人的屠杀，都为此提供了有力的证明。

总而言之，雅典对军事殖民地原住民的处置是与该地的地理位置、原住民的数量及对雅典的态度、雅典的战略布局等问题息息相关的，故对原住民的处置并未形成完整的章程，对于雅典军事殖民地的研究也不能一概而论。

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