朱元璋还活着的时候，因为他的权势、家族、声望、兵权，诸位诸侯都老老实实的做着自己的事情，从来没有做过什么过分的事情，更别说对他图谋不轨。不过，在明末二十五年，情况发生了翻天覆地的变化。就在这一年，皇储朱标突然暴毙。根据皇位继承的规矩，一众藩王都有资格登上皇位，而晋王和燕王更是因为天赋异禀，战力超群，被认为是最有希望登上皇位的人选。但朱元璋还是作出了一个让很多人大惑不解的决定：他把朱标的儿子，也就是他的孙子，朱允炆册封为储君。

这个决定很难让人信服。因为有朱元璋在，各大诸侯也不好明表自己的意见，所以，他们虽然在明面上表示了全力支持，可内心深处，对于朱允炆成为储君，还是有些不解和不快的。按理说，朱允炆这样的后生晚辈，是不可能继承皇位的。不过朱元璋身为一国之君，心志坚定，没有人能够改变他的决定，诸位诸侯也只能无奈的离开了，没有再多说什么。这件事情牵扯甚广，不仅引起了燕王和晋王的不满，就连其他诸侯也是怨声载道。这也是为什么，朝廷和诸侯们会产生矛盾的原因，尤其是朱元璋驾崩，朱允炆继位之后，矛盾更加激化，最终变成了“保藩”和“削藩”的矛盾。朱允炆登上皇帝宝座后，感觉到了自己的位置不稳定，受到了极大的威胁，就下达了铲除藩王的命令。

在朱元璋去世的那一天，也就是洪武31年（1398年），一直到第二年秋天，朱允炆以种种理由剥夺了周，齐，湘，代，岷五王的爵位，并且将矛头对准了矛盾最大，也是最有权势的“燕王”。为了一鼓作气将燕国一网打尽，朱允炆在洪武31年11月，任命张昺为北平布政使者，谢贵和张信掌北平总管，并命他们严密监控燕国的动静。其后，又于建文二年（1399年）2月，颁布了一道敕令，明令各亲王，不许对自己的亲王府文武百官进行任何限制。这一年三月份，朱允炆下令宋忠，徐凯，耿瓛等将军在北京周边开平，临清，山海关三处驻扎军队，并从北京，永清两处防御区域抽调兵马，运粮到彰德，顺德。

建文帝朱允炆削藩的一系列举动，都落到了朱棣的眼中。朱允炆还没来得及做好充足的准备，朱棣便于建文元年的秋天（1399年八月）发动了政变，并以“清君侧”之名发动了“靖难”之战。“靖难之役”，也就是明代的第一次家族内讧，朱允炆是侄儿，朱棣是叔叔，叔侄二人为了争夺皇位而发生了冲突，好不容易恢复了平静的明朝，却再次陷入了混乱和战争的泥潭。在靖难之战开始的时候，燕国处于劣势，朱棣只有北京和一万大军，而朱允炆却拥有中国辽阔的疆域，是朱棣的三倍之多，还有一群诸侯。单从表面上来说，朱棣处于绝对的劣势。然而，在朱棣的带领下，不但反败为胜，而且还取得了巨大的胜利，一举扭转了劣势，击溃了朱允炆的军队，在三年后，也就是1402年5月20日，他在长江的北岸，占领了南京的龙江驿站，逼迫建文帝朱允炆交出了自己的罪行，并且派出了庆阳公主，试图与朱棣和谈。事情到了这一步，已经没有退路了，朱棣断然拒绝了和谈的提议，在6月13日，朱棣率领军队，直逼南京城，朱橞，李景隆，以金川门谋反为借口，将朱棣迎进了京。进京后，朱棣第一时间赶到朱允炆居住的内院，却看到一片火光冲天的景象，而朱允炆和他的家人，已经消失得干干净净。朱棣未看到朱允炆的头颅，勃然大怒，命人在南京城中挖了一圈，也没有找到朱允炆的踪迹。朱棣也是一头雾水，朱允炆就像是从这个世界上消失了一样，这世上怎么会有这么奇怪的事情？