太宗时期的第一猛将是护国公秦琼秦叔宝。秦琼在隋唐后期确实是一员猛将。他带领瓦岗兄弟投奔秦王李世民，为李壮大了夺取天下的力量，秦琼本人也为唐朝的建立立下了汗马功劳。是唐朝开国将领、凌烟阁二十四功臣之一。秦琼在李世民手下不假，他降的是李渊，也是李渊派他去帮衬李世民的，绝大部分封赏也是李渊给秦琼的。李世民从来没敢拿秦琼当兄弟，这也是李世民聪明的地方。也可以说从始至终她就没有相信过秦叔宝。

首先一点就是玄武门之变表现不积极，从史书上记载并无证据表明秦琼没有参与玄武门之变，他只是没有尉迟恭那么积极而已。我们从影视剧中了解到的秦叔宝是个义薄云天的人，因为李渊对他不薄，不忍见李氏兄弟互相残杀，他受李渊厚待，更不想让高祖为难。在兵变是他选择的是中立的态度，所以此时秦琼在李世民映像里很不好，认为秦琼不赞同自己的做法。

第二点，主要是因为秦叔宝早年久经沙场，各种伤病，作为一名武将战功是很重要的，没有战功领导怎么会跟你升职加薪呢，后期伤痕累累，久病缠身，基本上没有什么战功。凌烟阁里面主要记载的是第一批开国功臣，是在秦叔宝死后才建立的，对于李世民来说是为了表彰曾经的手足情深的战友其中肯定添加了一些个人情感在里面。

从感情上看秦琼和李世民非亲非故。从凌烟阁二十四功臣排名看，排在前面的要么是皇亲国戚，李道宗、长孙无忌等皇亲国戚，要么是唐朝初期的功臣和走的比较紧的一些人，尉迟敬德多次护驾就在其中等等，反观秦叔宝，生前前本不受待见，而且作为一名已故的人来说根本也没有机会去争辩其中的排名了。