近几年来,基因编辑技术应用于慢乙肝药物开发方向,已在临床前研究中表现出潜力,其中就包括临床阶段生物技术公司(Precision BioSciences)研发的PBGENE-HBV,预计2024年IND。
用工程ARCUS来识别HBV,来自Precision Bio乙肝药物开发趋势,ARCUS-POL核酸酶,减少cccDNA及HBsAg可行性
慢性乙肝(CHB)的持续存在,归因于肝内共价闭合环状DNA(cccDNA)的持续存在。当然,较为前沿的研究路径包括病毒进入抑制剂、衣壳抑制剂、RNAi(siRNA和ASO多见),以及一些新型免疫疗法(不直接针对HBV,而是针对免疫研发药物)抗PD-1抗体、Toll样受体激动剂和治疗性疫苗等。
以上科学前沿技术开发的乙肝在研创新药,均是将目标定在功能性治愈HBV。相较于它们,Precision Bio公司科学家研究的以HBV cccDNA为目标的序列特异性ARCUS核酸酶应用,也值得国内研发人员和研究人员关注,因为它是一种直接靶向cccDNA,有可能实现清除性治愈HBV,也是未来科研人员需要进入的研究领域。
靶向HBV聚合酶的ARCUS核酸酶(ARCUS-POL)的瞬时表达在今年HBV国家会议中(法国巴黎举行),Precision Bio带来了基因编辑乙肝候选药物临床前最近进展。已开发的一种基因编辑巨型核酸酶,ARCUS-POL,它已证明有能力切割cccDNA和整合的HBVDNA,导致sAg和cccDNA的减少。在HBV感染的原代人肝细胞中短暂表达ARCUS-POL后,cccDNA和HBsAg都大幅减少。
为了在体内评估ARCUS-POL,Precision Bio科学家还开发了外显体腺相关病毒(AAV)小鼠和非人灵长类动物(NHP)模型,其中含有部分HBV基因组,作为cccDNA的替代物。
ARCUS基因被破坏的机制什么是ARCUS?ARCUS是一种源自I-CreI的单组分蛋白,包含一个22bp的特异性DNA识别界面和内切酶活性。ARCUS的小尺寸(364 aa)使它很容易被包装到AAV或纸质纳米粒子(LNP)中,以便有效地传递到细胞核。
Precision Bio科学家假设,核酸酶介导的双链断裂可能导致cccDNA的降解或产生突变、无复制能力的cccDNA,这两种结果都可能导致HBsAg减少。为了努力实现治愈HBV,Precision Bio科学家设计并优化了一种基因编辑ARCUS核酸酶(ARCUS-POL),它能够特异性地切割HBVDNA聚合酶开放阅读框(ORF)中一个特定的22个碱基对序列。
ARCUS编辑后cccDNA的结果结果表明,第5代ARCUS-POL核酸酶在HBV感染PHH中抗病毒活性方面:原代人肝细胞(PHH)重新转导HBV并转染Gen 5 ARCUS-POL或非靶向核酸酶。在转导后第17天,ARCUS-POL核酸酶处理导致cccDNA减少了约85%(3A,3B),剩余的cccDNA有29%的 indels(3C)。经ARCUS-POL处理的细胞显示,细胞外HBVDNA减少80%(3D),分泌的HBsAg减少77%(3E),而分泌的白蛋白没有变化(3F)。
Gen 5 ARCUS-POL核酸酶在HBV感染的PHH中的抗病毒效果第5代ARCUS-POL核酸酶在外显体AAV小鼠模型方面:NSG小鼠模型试验中,给予实验鼠AAV9-HBsAg载体,三周后给予含有Gen 5 ARCUS-POL mRNA的LNPs。与PBS对照组相比,ARCUS-POL核酸酶处理导致肝脏中的AAV copies大量丢失(4A),剩余的AAV中有80%的 indels(基因序列发生的插入或缺失改变)(4B)。基因编辑导致血清HBsAg水平下降96%(4C),肝脏中HBsAg表达大量丧失(4D)。
第5代ARCUS-POL核酸酶在外显体AAV小鼠模型中的评价第5代ARCUS-POL核酸酶在外显子NHP模型方面:尽管观察到免疫抑制,但NHPs无法维持分泌的HBsAg作为生物标志物使用。总核酸酶参与导致AAV-HBsAg cccDNA替代物的编辑或降解估计为83%。这些数据共同证明了ARCUS-POL核酸酶,在NHPs中切割外显AAV8-HBsAg的能力,导致AAV基因组拷贝的减少和预期目标部位的 indels!
第5代ARCUS-POL核酸酶在外显子NHP模型中的评价综上所述,Precision Bio科学家给出结论是:我们已开发了小鼠和NHP模型,使用到了临床上可转化的 LNP/mRNA 传递技术来评估ARCUS的体内和BV基因编辑能力。这些非临床研究数据证明,使用ARCUS-POL核酸酶的基因编辑方法来减少cccDNA和分泌的HBsAg可行性,目的是实现对HBV患者的治愈。
小番健康结语:这种技术应用比较新颖,国内暂时还没有基因编辑技术应用于乙肝创新药的研发工作,它也是为数不多可以直接影响cccDNA的科学技术。全球现有基因编辑乙肝创新药,除Precision Bio的PBGENE-HBV,还有Beam Therapeutics碱基编辑器(CBEs)和Excision BioTherapeutics的EBT-107,它们都在临床前阶段。
以上这些新药研发进展,主要为医药工作者学习交流,推动我国生物制药与国际前沿技术接轨,不是治疗建议,如需用药指导请到正规医院。随着越来越多以功能性治愈HBV的医药技术应用(主要以开发大幅调降乙肝表面抗原或影响机体免疫类药物),包括病毒进入抑制剂、乙肝表面抗原抑制剂(核酸聚合物等)、衣壳抑制剂、siRNA/ASO、Toll激动剂、治疗性疫苗、PD-1/PD-L1等,今后趋势是科学家将更多聚焦于cccDNA领域的药物开发工作。