奇门遁甲这个名称，最早形成于明清，以前不叫奇门遁甲。最早的名字叫阴符，所用盘叫雷公式。大约在东汉末年、晋朝时叫遁甲。

《烟波钓叟歌》记载：轩辕黄帝战蚩尤，涿鹿经年苦未休，偶梦天神授符诀，登坛致祭谨虔修，神龙负图岀洛水，彩凤衔书碧云里，因命风后演成文，遁甲奇门从此始，一千八十当时制，太公删成七十二，逮于汉代张子房，一十八局为精艺。

《周易》记载河出图，洛出书，河图是伏羲时出现，洛书是大禹时出现，我们知道，奇门遁甲起局，就是依据洛书九宫、后天八卦、二十四节气，而洛书九宫是大禹时出现，比黄帝晚，后天八卦出自《周易》，是周文王所创，晚于黄帝，而二十四节气，最早出现于西汉时期。《夏小正》中说到：“五月，时有养日；月，时有养夜。”这里的“养日”和“养夜”，其实就是指现今我们说到的白天时间最长的夏至日，以及黑夜时间最长的冬至日。又如《尚书·尧典》中就有关于日中、日永、宵中、日短”的记载，它们分别对应的就是春分、夏至、秋分、冬至。在夏商周时期还没有二十四节气。

二十四节气名称首见于西汉刘安的《淮南子·天文训》,《史记·太史公自序》的“论六家要旨”中也有提到阴阳、四时、八位、十二度、二十四节气等概念。 公元前104年,由邓平等制定的《太初历》把二十四节气定于历法。

这说明奇门遁甲形成在战国至秦汉期间。它的形成也经过几次的演变。但不是什么风后、太公删减，它最初形成一千八十局，后有删减为七十二，最终为一十八局，最有可能的原因是当时的历法的变迁造成的，一开始历法不完备，随着时间推移，历法越来越精确，形成了二十四节气，最终它就定型为十八局。这十八局可能确实是张良定型的，因为二十四节气被正式写入历法，在这之前一段时期应该已经形成一段时间，成熟后才会被正式收入官方。另一个依据就是《史记》中刘邦的一句话：夫运筹策帷幄之中，决胜于千里之外，吾不如子房。运筹策，正是奇门遁甲法术里记载的内容，在奇门遁甲里记载（哪一章记不清了）运筹，《奇门遁甲全书》·真人闭六戊法里也有运筹字样。当然，以刘邦的文化程度不可能说出这么文雅的话，这是司马迁加工的结果。

也就是说，我们现在所使用的奇门遁甲，根本就不是什么皇帝时期流传下来的，那些只是传说而已。

奇门遁甲最初的作用也不是用来占卜，而是用来行兵作战，而且它里面也存在法术内容，也就是说，有法术和阵法的奇门遁甲，才是真正的奇门遁甲。它的形成应该比我们现在所使用的奇门遁甲要早一些。我们现在所使用的奇门遁甲，被后世加入了许多内容，比如说占卜，选择（择日择方），地理风水（阴阳宅），算命，道家符咒等内容，这些都是后世加入的。还有奇门的各种起局方法，飞盘、转盘等，都是后世加入的。究竟说哪个奇门是真正的奇门，那肯定是阵法和法术奇门了。

要说侧重占卜的数理奇门，无法说哪个是正宗，因为都是后加入的，只能说哪个算的最准，我们就遵循哪个了。