过了一段时间，刘武周策划从突厥逃回马邑，事情泄露，突厥杀了刘武周。任命苑君璋为大行台，统领刘武周的余部，仍然令郁射设督兵协助镇守。 武德四年（621年），代州（今山西代县）总管李大恩击败苑君璋。武德五年（622年）三月，唐朝并州总管刘世让驻扎在雁门，颉利可汗与高开道、苑君璋合兵攻打刘世让，一个多月才退军。 武德六年（623年）五月，苑君璋与刘武周旧将高满政一道夜袭代州（今山西代县），未能攻下。唐高祖李渊派遣使者劝他归附唐朝，赐予铁券，保证不杀。苑君璋拒不接受，并再次进犯代州，唐朝代州刺史王孝德将其击退。高满政劝苑君璋杀死所有的突厥守军投降唐朝，苑君璋不听。而马邑困于兵祸，人心厌乱，高满政利用人心所向，半夜袭击苑君璋，苑君璋发觉后逃奔突厥。高满政杀死苑君璋的儿子以及突厥的二百名守军投降唐朝。
