1948年底，胡适南飞。 首先想到的不是陈寅恪而是辅仁大学校长陈垣，遂力邀一同飞往南京。可惜陈垣拒绝飞往南京，继续留在辅仁大学当校长。要亲身体会一下新社会，新国家，新气象。 49年，解放军进入北京，陈垣组织辅仁大学师生夹道欢迎。亲眼目睹了这一全新盛世。 同时，对胡适曾经说过的″面包自由论"给予了严厉的批判。 说道:我以为你比我看得远，看得准。可今天数以万计的青年学生走到解放区，而且又有数百万计的青年正在向解放区走来时。你还能坚持你曾经说过的话吗？三十年前，你是青年″导师″，在这是非分明昭然若揭的当下，你却走到了人民的对立面，为反动派站台，摇旗、呐喊，是非不分，为虎作伥。我真诚的奉劝你，你应该悬崖勒马，回头是岸。真心的祈求人民来拯救，宽恕你。 59年，当天空中微微有些寒意时，陈垣多次申请入党，最终成功。准备一颗红心，全部奉献给人民。 当马寅初受到批判时，陈垣已感受到寒风刺骨。感叹道:那些不做研究，没有著作的人，什么事情都没有；而我们这些认认真真，勤勤恳恳做学问，搞研究，出著作的人却要被批判。早知这样真不如不做了。 这时的他是否后悔没有听从胡适的邀请。 后来风暴袭卷时。 陈垣也未能幸免于难。只是年事已高，限制自由。于1971年去世，享年92岁。
