南京农业大学发布迄今世界最大植物基因组

分子有植物 2024-10-27 13:08:32
2024年10月24日,南京农业大学园艺学院滕年军教授团队、薛佳宇副教授团队,华中农业大学园艺林学学院宁国贵教授团队与福建农林大学明瑞光教授团队等国内10多家科研团队联合公布了百合高质量染色体级别基因组,成为世界上首个正式报道的最大植物基因组。相关文章“The evolutionary tale of lilies: Giant genomes derived from transposon insertions and polyploidization”发表在《The Innovation》期刊。 [种草R]百合(Lilium L.)是单子叶百合目百合科多年生植物,因其极高的观赏、食用与药用价值而备受关注。本研究利用Nanopore、Illumina和Hi-C测序技术,以及优化的组装方法,获得了36.68 Gb的兰州百合(Lilium davidii var. unicolor)超大型基因组,并解析了其形成机制和特征,也揭示了鳞茎营养物质积累的遗传基础。这一成果标志着百合的分子研究进入新时代,也是植物基因组学的重要突破性研究进展之一。 [种草R]南京农业大学为该论文的第一署名单位和通讯单位,南京农业大学钟山青年研究员徐素娟博士、已毕业硕士张心祺、吴玉峰教授,华中农业大学博士生陈润洲以及上海市农科院杨柳燕研究员为论文的共同第一作者;南京农业大学滕年军教授、薛佳宇副教授,华中农业大学宁国贵教授以及福建农林大学明瑞光教授为论文共同通讯作者;北京林业大学、海南大学、云南大学、扬州大学、山西农业大学、沈阳农业大学、北京农学院、甘肃农业大学、甘肃农科院、湖南农科院、长江师范学院、武汉希望组生物科技有限公司、江苏省栖霞百合科技小院等单位20多位合作者参与了本研究。本研究得到了国家重点研发计划(2019YFD1000400)、江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS〔2021〕093)等资助和南京农业大学生物信息学中心高性能计算平台的支持。
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