1388年，蓝玉攻破北元王庭后，色心顿起，不仅私留蒙古婢女，还把魔爪伸向元主的妃子。朱元璋震怒，但蓝玉毫不在乎：“就凭老子这些年的功劳，要几个女人伺候伺候，有何不可？”蓝玉是淮西勋贵集团的重要人物，不仅战功赫赫，而且还是开平王常遇春的小舅子。蓝玉起初在姐夫常遇春帐下效力，作战勇敢，所向披靡。所以，常遇春多次在朱元璋面前夸奖自己的小舅子。蓝玉也不负姐夫的提携栽培，在获得一系列战功之后，被封为永昌侯，女儿也被册封为蜀王妃。蓝玉从此跨进皇亲国戚的行列，备受朱元璋器重。1387年，蓝玉以征虏右副将军身份，随大将军冯胜出征纳哈出。纳哈出自知无力抵抗，亲自率部投降。蓝玉设盛宴款待，亲自为他敬酒。纳哈出一饮而尽，又斟酒回敬蓝玉，蓝玉却脱下自己的汉服，对他说：“请换上此服再饮！”纳哈出认为这是对他的侮辱，拒不接受，蓝玉也不肯喝他敬的酒。双方争执不下，纳哈出将酒泼到地上，就要率部下离去。幸好冯胜从中斡旋，这才招抚了纳哈出溃散的部众，然后下令班师。这次出征，尽管蓝玉违反了朱元璋“因俗而治”的民族政策，但朱元璋随后还是拜他为大将军，移屯蓟州。可见，此时的朱元璋对蓝玉有多么倚重。1388年，朱元璋命蓝玉为征虏大将军，统率十五万大军北征。蓝玉在捕鱼儿海（今贝尔湖），出其不意发动袭击，杀死北元太尉蛮子，俘获脱古思帖木儿次子地保奴、爱猷识理达腊妃及公主以下百余人，又追获吴王、代王及其官属3000人、男女7700人，还有宝玺、符敕、金牌、金银印等物，马驼牛羊15万余。不久，又袭破北元丞相哈剌章的营盘，缴获人畜6万。朱元璋闻报大喜，夸赞道：“蓝玉就是朕的卫青、李靖！”蓝玉为明王朝的建立和巩固立下了赫赫战功，但他是个粗鄙的武夫，不免滋长了居功自傲的思想。北征归来的时候，蓝玉率军夜至喜峰口，因为关吏没有及时打开关门迎纳，便纵兵破关而入。这时候，有人还向朱元璋密告，说蓝玉欺辱北元皇妃，以致皇妃羞愤自杀。朱元璋大怒，把原定封蓝玉为梁国公的“梁”改为“凉”，还把他的过错刻在铁券上。但蓝玉却不知悔改收敛，仍然一如既往地骄纵不羁。终于，蓝玉的所作所为，引起了朱元璋深切的关注和忧虑。皇太子朱标去世后，朱元璋诏立朱允炆为皇太孙，作为将来的皇位继承人。此时的朱元璋已是65岁高龄，而朱允炆只有16岁，性格又酷似他父，仁柔宽厚。朱元璋担心自己百年之后，年轻的皇太孙心慈手软，控制不住局面，如果那些久经战阵、老谋深算的功臣们不服调遣，后果将不堪设想。而在朱标去世时，燕王朱棣自北平来朝所说的一番话，令朱元璋更加忧虑不已。事情是这样的，蓝玉作为太子妃常氏的舅舅，曾关心地提醒皇太子：“臣听人说燕地有天子气，殿下要小心燕王！”但皇太子却说：“燕王对我挺好的。”并没有将这话放在心上。后来，蓝玉的话传到燕王耳朵里，朱棣就恨死了蓝玉，皇太子一去世，入京朝见时便到处散布：诸公侯骄纵不法，朝廷将有尾大不掉之忧。朱元璋由此对手握重兵的开国功臣更加疑忌，不禁想起，一次在命蓝玉出征前，蓝玉和十几个部将陛辞时，他让诸将先走一步，想留蓝玉单独面授机宜，谁知连呼三声，竟没有一人离开，但蓝玉只是挥了挥衣袖，这些将领便都赶忙退了出去。朱元璋想不到蓝玉已经冠绝诸将，于是对他更是疑忌，对他的一举一动更加关注。然而，蓝玉却浑然不察，还在为未得到太子太师一职而闷闷不乐。蓝玉联想到亲家靖宁侯叶昇因胡案被杀，就怀疑是他的口供里指认自己是胡党，以致引起朱元璋的猜忌，才令他失去太子太师一职。于是，蓝玉认为早晚朱元璋也饶不了自己，倒不如趁早反了。此时，朱元璋因受皇太子病死的打击太大，病倒了。蓝玉认为正是下手的好机会，于是暗中联络老部下密谋策划，最后定在朱元璋外出耕籍田时起事。然而，这一切早被锦衣卫察觉。没等蓝玉动手，锦衣卫指挥蒋瓛就向朱元璋密报了。此时，经过明军的屡次打击，北元势力已陷入分裂状态，北部边防比较稳定，朱元璋决定再次大开杀戒，彻底铲除那些可能对朱家天下构成严重威胁的开国功臣，确保年轻仁柔的皇太孙将来能坐稳江山。1393年二月初八蓝玉被捕，第二天投入锦衣卫大牢，第三天就以“谋反”罪被处死，夷灭三族。朱元璋随即以蓝党的罪名，将一大批淮西勋贵及其子弟牵连诛杀，并将刑讯逼供得出的口供编入《逆臣录》，公布于世。蓝玉案总共大约杀了一万五千人，包括一公、十三侯、二伯。至此，淮西勋贵势力被完全铲除。朱元璋通过蓝玉案打击了骄横跋扈的功臣势力，自然有其积极的意义，但大规模的诛杀，其消极的影响也不容忽视。朱元璋死后，燕王朱棣起兵“靖难”，建文帝朱允炆无将可用，先后起用年迈的老将耿炳文和没有作战经验的李景隆为大将军，结果均遭败绩，就是一个很好的例证。朱允炆的皇位被篡夺，自然也就势在必然了！