明朝初期的“南北榜”一案，其根本原因并非简单的南北读书差异，而是背后复杂的政治与经济利益的较量。此案深刻地反映了当时社会阶层固化与地域集团之间的权力斗争。

在明朝早期，江西、浙江、福建地区的程朱理学门阀及其背后的江南地主集团，通过科举制度，试图操控朝政，将权力集中在自己手中。他们利用手中的资源和影响力，在科举考试中形成了近乎垄断的局面，导致其他地区的士子难以获得公平的机会。

在洪武三十年的第六次科举考试中，这种趋势达到了顶峰。江西、浙江、福建三省的士子几乎垄断了榜单，而其他地区的士子则寥寥无几。这种明显的地域倾斜，不仅违背了科举制度的初衷，也引起了社会的广泛不满和质疑。

朱元璋作为明朝的开国皇帝，自然不能容忍这种明显的权力垄断。他试图通过改革科举制度，来打破这种地域垄断的局面。然而，由于江南地主集团的强大影响力和复杂的政治斗争，使得改革进展缓慢，效果有限。

在“南北榜”一案中，朱元璋虽然最终对涉案人员进行了严惩，但并未能从根本上解决问题。江南地主集团依然通过各种手段，继续操控科举考试和朝政大权。直到明朝中后期，随着政治斗争的加剧和社会矛盾的激化，这种地域垄断的局面才逐渐得到缓解。

综上所述，“南北榜”一案的根本原因，是明朝初期社会阶层固化与地域集团之间的权力斗争。这种斗争不仅影响了科举制度的公正性，也阻碍了明朝社会的健康发展。