西宁海关于1998年10月8日正式开关。西宁海关是受海关总署直接领导，负责指定口岸及相关区域范围内海关工作运行管理、监督监控的正厅级直属海关，领导曹家堡机场海关、西海海关、格尔木海关。西宁海关管辖范围为青海省的各项海关管理工作。主要职责是：
（一）负责本关区贯彻落实党中央、国务院关于海关工作的方针政策和决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对海关工作的集中统一领导，履行全面从严治党主体责任。
（二）负责贯彻执行与海关管理相关的法律、法规、规章。规范性文件和相关技术规范，负责本关区征税、监管、缉私、出入境检验检疫、统计等工作。
（三）监控研判本关区各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责本关区基层党组织建设、队伍建设和日常管理工作。
（四）完成海关总署交办的其他工作。
现任领导党委书记、关长：尹卫锋
尹卫锋，男，汉族，1967年12月出生，湖南桂阳人，中共党员，大学本科，1987年7月参加工作。现任西宁海关关长、党委书记。
党委委员、副关长：朱雪迎
朱雪迎，男，汉族，1965年7月生，山东东明人，1998年9月加入中国共产党，1987年7月参加工作，合肥工业大学金属材料及成型技术系热处理专业毕业，中央党校在职研究生学历，高级经济师。 现任西宁海关副关长、党委委员、一级巡视员。
党委委员、政治部主任：李鸣
李鸣，男，汉族，中共党员，现任西宁海关政治部主任、党委委员。
党委委员、副关长：肖宇
肖宇，男，汉族，中共党员，现任西宁海关副关长、党委委员。
党委委员、副关长：高卿
高卿，男，汉族，中共党员，现任西宁海关副关长、党委委员。
党委委员，缉私局党组书记、局长兼督察长：张卫华
张卫华，男，汉族，中共党员，现任西宁海关缉私局局长兼督察长、关党委委员、局党组书记。
党委委员、党委纪检组组长：张胜
张胜，男，汉族，中共党员，现任西宁海关党委委员、党委纪检组组长。
