病例介绍

患者，女，17岁，阵发性咳嗽20余天。经验性给予哌拉西林他唑巴坦联合阿奇霉素抗感染，未见明显疗效。

胸部CT：左肺上叶支气管扩张、肺大疱伴感染；左肺上叶肺气肿。

鉴别诊断：（1）肺结核；（2）急性肺脓肿；（3）肺癌。

辅助检查：纤维支气管镜取肺泡灌洗液4 ml行mNGS（宏二代基因测序技术）检测：盖尔森基兴诺卡菌阳性，序列数90。

治疗：明确病原菌后给予复方磺胺甲恶唑治疗，以及化痰、营养支持等对症处理。

病例图片

胸廓不对称，左肺上叶体积增大，局部肺纹理稀疏、密度减低；左肺上叶多灶性实变，左肺上叶多发小囊状低密度影，较大者内见液平，邻近胸膜增厚，左肺上叶支气管狭窄。纵隔右移，纵隔内见肿大淋巴结影。考虑左肺上叶先天多囊性病变，伴局限性肺气肿、肺大泡及含气肺囊肿，部分肺组织机化，肺内散在纤维灶。

病例思考

第一，目前二代测序进入到了“3小时时代”。正如本例提示，感染测序应用公司已经具有次日出报告的能力。对于普通细菌性感染，mNGS出结果更快，有助于迅速明确危重症感染的病原体。

第二，mNGS也有一定的局限性：检测成本高；样本人源核酸占比高会使病原微生物检测灵敏度降低，及漏检一部分耐药或毒力基因；若检测的随机片段没有覆盖到分型区段，可能无法对近源病原体进行精准分型；无法进行药敏试验。

第三，目前mNGS检查不能完全替代传统培养方法，但可以作为重要补充检查。

知识链接

66内科学第10版第130页

宏基因组下一代测序（mNGS）能够快速检测各种病原微生物，能检测到其他传统方法难以识别的病原体，包括诺卡菌、肺孢子菌、结核分枝杆菌、肠杆菌、链球菌、具核梭形杆菌、牙龈卟啉单胞菌等。

既往笔记

二代测序技术结合常规方法检测脑炎/脑膜炎病原体

二代测序在内脏利什曼病诊断中的应用

2024-10-29