日前，河南省农业科学院畜牧研究所与北京康普森农业科技有限公司合作，成功研发出具有完全自主知识产权的河南首个地方肉牛芯片“豫牛一号”。该芯片不但可用于肉牛全基因组选择育种、重要经济性状功能基因挖掘，还可用于河南本地肉牛品种遗传特性解析、品种鉴定、资源保护等工作。

河南目前有南阳牛、郏县红牛、夏南牛、皮南牛、德南牛5个肉牛种源，它们具有体躯高大、肌肉发达、体质结实、肉质细腻等优质特性，蕴藏着宝贵的遗传基因。然而，由于缺乏有效的鉴定和评价手段，这些珍贵的资源难以得到充分保护和利用。传统的肉牛育种方法主要依赖于表型选择，效率低、周期长。基因芯片技术能够快速、准确地检测出肉牛与重要经济性状相关的基因，从而加速优良品种的选育进程。

“豫牛一号”的开发是利用河南省全部5个肉牛种源（南阳牛、郏县红牛、夏南牛、皮南牛、德南牛）重测序数据，在全基因组中挖掘高检出率、高MAF、基因组均匀分布的SNP位点41580个，同时基于肉牛通用芯片功能位点，将已发表的世界优良牛种的与生长、抗病、毛色、饲料转换率等14个性状显著关联的8420个SNP分子标记纳入“豫牛一号”，共计50000个SNP位点。该芯片平均检出率可达99.3%，重复样本分型一致率达99.8%，具有基因组覆盖全面、检测成本低、分型效果好、分型准确率高等特点。该芯片不但可用于肉牛全基因组选择育种、重要经济性状功能基因挖掘，还可用于河南省本地肉牛品种遗传特性解析、品种鉴定、资源保护、新品种开发等工作。利用“豫牛一号”将进一步促进“中原牛”、“皮南牛”、“德南牛”等新品种选育提升，强化技术指导，着力推进新品种培育。

解读河南地方牛品种“遗传密码”

“豫牛一号”育种芯片是以5个河南省本地肉牛品种或群体遗传信息为基础设计而来，未来可用于河南省本地肉牛的种质资源遗传多样性解析、亲缘关系分析、近交评估、亲子鉴定、性状调控基因挖掘、品种鉴定、选配优化等工作，通过全面解读河南地方牛品种“遗传密码”，高效地实现肉牛品种的遗传改良。

河南地方牛品种基因组选择

基因组选择（GS）可利用覆盖全基因组的分子标记构建预测模型，并对育种群体的基因组估计育种值（GEBV）进行预测，实现早期个体选择，缩短世代间隔，加快育种进程。已有GS研究显示，加入与预测性状关联的分子标记，能有效提高GEBV预测的准确性。“豫牛一号”在全基因组覆盖位点的基础上，加入了8420个与14个重要性状（生长、抗病、毛色、饲料转换率等）关联的SNP位点，后续在开展河南地方牛品种选育时，可提升相关性状的基因组选择的准确性，加速河南地方肉牛新品种培育的进程。

靶向捕获目的位点，保证基因分型准确性

芯片设计基于康普森CAGT®靶向捕获测序技术，利用靶向探针精准捕获目标位点区域，实现目标位点的高深度测序，保证基因分型准确性。

高灵活性，高性价比

可根据需求适当增加/删减标记位点，进一步满足不同的产品应用场景。基于国产化设计、检测和分析流程，大大降低分型成本；采用自动化检测流程，提升检测通量和稳定性。